Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms