Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Xab2Q9DCD2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.6 ms