Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ccdc97Q9DBT3 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ccdc97Q9DBT3 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Ccdc97Q9DBT3 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Ccdc97Q9DBT3 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ccdc97Q9DBT3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ccdc97Q9DBT3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ccdc97Q9DBT3 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ccdc97Q9DBT3 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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