Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms