Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms