Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem54Q9D7S1 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms