Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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