Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Tubgcp4Q9D4F8 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Tubgcp4Q9D4F8 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Tubgcp4Q9D4F8 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Tubgcp4Q9D4F8 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Tubgcp4Q9D4F8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Tubgcp4Q9D4F8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Tubgcp4Q9D4F8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
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Tubgcp4Q9D4F8 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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