Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1138 ms