Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Zbed3Q9D0L1 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Zbed3Q9D0L1 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Zbed3Q9D0L1 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Zbed3Q9D0L1 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Zbed3Q9D0L1 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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