Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.6 ms