Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms