Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atxn3Q9CVD2 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms