Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms