Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Hps4Q99KG7 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Hps4Q99KG7 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Hps4Q99KG7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Hps4Q99KG7 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Hps4Q99KG7 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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