Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Hoxc12Q8K5B8 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Hoxc12Q8K5B8 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Hoxc12Q8K5B8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Hoxc12Q8K5B8 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Hoxc12Q8K5B8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
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