Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms