Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZX4

Rbm17, Splicing factor 45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm17Q8JZX4 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 4896.7 ms