Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab11fip3Q8CHD8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
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