Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI2

Cdc34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc34Q8CFI2 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdc34Q8CFI2 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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