Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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Usp27Q8CEG8 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Usp27Q8CEG8 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Usp27Q8CEG8 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Usp27Q8CEG8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Usp27Q8CEG8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Usp27Q8CEG8 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Usp27Q8CEG8 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Usp27Q8CEG8 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Usp27Q8CEG8 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Usp27Q8CEG8 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Usp27Q8CEG8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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