Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Atg4aQ8C9S8 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4aQ8C9S8 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4aQ8C9S8 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Atg4aQ8C9S8 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Atg4aQ8C9S8 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4aQ8C9S8 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4aQ8C9S8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Atg4aQ8C9S8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4aQ8C9S8 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4aQ8C9S8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Atg4aQ8C9S8 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4aQ8C9S8 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4aQ8C9S8 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Atg4aQ8C9S8 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Atg4aQ8C9S8 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Atg4aQ8C9S8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Atg4aQ8C9S8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg4aQ8C9S8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Atg4aQ8C9S8 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Atg4aQ8C9S8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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Atg4aQ8C9S8 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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