Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
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Pggt1bQ8BUY9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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Pggt1bQ8BUY9 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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Pggt1bQ8BUY9 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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Pggt1bQ8BUY9 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
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Pggt1bQ8BUY9 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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Pggt1bQ8BUY9 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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Pggt1bQ8BUY9 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
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Pggt1bQ8BUY9 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms