Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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