Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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