Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Sh3rf1Q69ZI1 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3rf1Q69ZI1 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3rf1Q69ZI1 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3rf1Q69ZI1 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3rf1Q69ZI1 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Sh3rf1Q69ZI1 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3rf1Q69ZI1 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3rf1Q69ZI1 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3rf1Q69ZI1 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3rf1Q69ZI1 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3rf1Q69ZI1 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3rf1Q69ZI1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3rf1Q69ZI1 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3rf1Q69ZI1 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Sh3rf1Q69ZI1 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Sh3rf1Q69ZI1 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3rf1Q69ZI1 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Sh3rf1Q69ZI1 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Sh3rf1Q69ZI1 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3rf1Q69ZI1 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3rf1Q69ZI1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Sh3rf1Q69ZI1 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Sh3rf1Q69ZI1 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3rf1Q69ZI1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Sh3rf1Q69ZI1 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Sh3rf1Q69ZI1 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3rf1Q69ZI1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3rf1Q69ZI1 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Sh3rf1Q69ZI1 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3rf1Q69ZI1 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3rf1Q69ZI1 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3rf1Q69ZI1 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3rf1Q69ZI1 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3rf1Q69ZI1 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3rf1Q69ZI1 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3rf1Q69ZI1 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3rf1Q69ZI1 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3rf1Q69ZI1 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3rf1Q69ZI1 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3rf1Q69ZI1 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3rf1Q69ZI1 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3rf1Q69ZI1 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3rf1Q69ZI1 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3rf1Q69ZI1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3rf1Q69ZI1 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3rf1Q69ZI1 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3rf1Q69ZI1 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3rf1Q69ZI1 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3rf1Q69ZI1 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3rf1Q69ZI1 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3rf1Q69ZI1 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3rf1Q69ZI1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3rf1Q69ZI1 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3rf1Q69ZI1 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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