Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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