Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
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PtprdQ64487 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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PtprdQ64487 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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PtprdQ64487 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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PtprdQ64487 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
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PtprdQ64487 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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PtprdQ64487 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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PtprdQ64487 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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PtprdQ64487 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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PtprdQ64487 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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