Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.5 ms