Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms