Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms