Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Urb1Q571H0 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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