Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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Znf48Q3US17 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Znf48Q3US17 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Znf48Q3US17 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Znf48Q3US17 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Znf48Q3US17 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Znf48Q3US17 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Znf48Q3US17 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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Znf48Q3US17 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Znf48Q3US17 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Znf48Q3US17 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Znf48Q3US17 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Znf48Q3US17 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Znf48Q3US17 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Znf48Q3US17 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Znf48Q3US17 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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