Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms