Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rnf180Q3U827 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rnf180Q3U827 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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