Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Cpne9Q1RLL3 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms