Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Ttc39dQ0VF76 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Ttc39dQ0VF76 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Ttc39dQ0VF76 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Ttc39dQ0VF76 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Ttc39dQ0VF76 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Ttc39dQ0VF76 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Ttc39dQ0VF76 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Ttc39dQ0VF76 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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Ttc39dQ0VF76 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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