Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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