Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms