Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NrepQ07475 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Svil-203ENSMUST00000126977 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
NrepQ07475 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms