Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Eno2-201ENSMUST00000004378 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Traf1-207ENSMUST00000172159 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Xpo7-201ENSMUST00000022696 4472 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Prkcd-208ENSMUST00000112211 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited1P97769 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms