Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps3aP97351 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms