Protein–RNA interactions for Protein: P63139

Nfyb, Nuclear transcription factor Y subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfybP63139 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NfybP63139 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NfybP63139 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NfybP63139 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NfybP63139 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NfybP63139 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NfybP63139 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
NfybP63139 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NfybP63139 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NfybP63139 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NfybP63139 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfybP63139 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfybP63139 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfybP63139 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfybP63139 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfybP63139 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfybP63139 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfybP63139 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfybP63139 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NfybP63139 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfybP63139 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfybP63139 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NfybP63139 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfybP63139 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfybP63139 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfybP63139 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfybP63139 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfybP63139 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfybP63139 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfybP63139 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfybP63139 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfybP63139 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfybP63139 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfybP63139 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NfybP63139 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
NfybP63139 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NfybP63139 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
NfybP63139 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NfybP63139 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfybP63139 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms