Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

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Length 162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
UbdP63072 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
UbdP63072 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
UbdP63072 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
UbdP63072 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
UbdP63072 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
UbdP63072 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
UbdP63072 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
UbdP63072 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
UbdP63072 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
UbdP63072 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
UbdP63072 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
UbdP63072 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
UbdP63072 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
UbdP63072 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
UbdP63072 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
UbdP63072 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
UbdP63072 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
UbdP63072 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
UbdP63072 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
UbdP63072 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
UbdP63072 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
UbdP63072 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
UbdP63072 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
UbdP63072 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
UbdP63072 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
UbdP63072 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
UbdP63072 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
UbdP63072 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
UbdP63072 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
UbdP63072 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
UbdP63072 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
UbdP63072 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
UbdP63072 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
UbdP63072 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
UbdP63072 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
UbdP63072 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
UbdP63072 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
UbdP63072 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
UbdP63072 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
UbdP63072 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
UbdP63072 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
UbdP63072 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
UbdP63072 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
UbdP63072 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
UbdP63072 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UbdP63072 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UbdP63072 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UbdP63072 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UbdP63072 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UbdP63072 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UbdP63072 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UbdP63072 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UbdP63072 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UbdP63072 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UbdP63072 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
UbdP63072 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UbdP63072 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UbdP63072 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
UbdP63072 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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UbdP63072 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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UbdP63072 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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UbdP63072 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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UbdP63072 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UbdP63072 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
UbdP63072 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UbdP63072 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UbdP63072 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
UbdP63072 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UbdP63072 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UbdP63072 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UbdP63072 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
UbdP63072 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UbdP63072 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UbdP63072 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UbdP63072 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UbdP63072 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
UbdP63072 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UbdP63072 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
UbdP63072 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
UbdP63072 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
UbdP63072 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
UbdP63072 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
UbdP63072 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
UbdP63072 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
UbdP63072 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
UbdP63072 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
UbdP63072 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
UbdP63072 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
UbdP63072 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
UbdP63072 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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