Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Eif2b3-201ENSMUST00000070610 1369 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gpatch2-202ENSMUST00000065573 4547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Zmat2-201ENSMUST00000001419 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Wdr89-202ENSMUST00000187307 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Pik3c3-202ENSMUST00000115811 3084 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm43633-201ENSMUST00000202455 2330 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Sorbs1-212ENSMUST00000225148 2379 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm13762-202ENSMUST00000168169 2180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Pinc-201ENSMUST00000190229 2170 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 A630009H07Rik-201ENSMUST00000208485 2159 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Sec31b-202ENSMUST00000111985 3548 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Olfr56-206ENSMUST00000203810 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Trp63-203ENSMUST00000115304 2634 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Cd300lb-203ENSMUST00000149663 2641 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Nfrkb-201ENSMUST00000086167 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Lyrm7os-201ENSMUST00000154044 928 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm36401-201ENSMUST00000194255 2028 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 D130040H23Rik-204ENSMUST00000212549 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Nedd1-201ENSMUST00000020163 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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