Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa6P50704 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa6P50704 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa6P50704 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa6P50704 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms