Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TgfaP48030 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms