Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc3P33622 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc3P33622 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc3P33622 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc3P33622 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc3P33622 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc3P33622 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc3P33622 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc3P33622 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc3P33622 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc3P33622 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc3P33622 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc3P33622 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc3P33622 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc3P33622 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc3P33622 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc3P33622 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc3P33622 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc3P33622 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc3P33622 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms