Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Saa4P31532 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Saa4P31532 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Saa4P31532 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Saa4P31532 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Saa4P31532 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms