Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TP20293 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TP20293 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
TP20293 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TP20293 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TP20293 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TP20293 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TP20293 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TP20293 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TP20293 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TP20293 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TP20293 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
TP20293 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TP20293 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TP20293 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TP20293 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TP20293 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TP20293 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
TP20293 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TP20293 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TP20293 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TP20293 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TP20293 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TP20293 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TP20293 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TP20293 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TP20293 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TP20293 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TP20293 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TP20293 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TP20293 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
TP20293 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TP20293 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TP20293 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TP20293 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
TP20293 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TP20293 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TP20293 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TP20293 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TP20293 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TP20293 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TP20293 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TP20293 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TP20293 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TP20293 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TP20293 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TP20293 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TP20293 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TP20293 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TP20293 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TP20293 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TP20293 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TP20293 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TP20293 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TP20293 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TP20293 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TP20293 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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TP20293 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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TP20293 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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TP20293 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TP20293 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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TP20293 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TP20293 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TP20293 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TP20293 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TP20293 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TP20293 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TP20293 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TP20293 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TP20293 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TP20293 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TP20293 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TP20293 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TP20293 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TP20293 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TP20293 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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